More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2431 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2431  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1286  chemotaxis protein CheY  80.92 
 
 		 131 aa  223  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1742  response regulator receiver protein  59.54 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000010553  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0539  response regulator receiver protein  60.31 
 
 		 132 aa  170  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2860  response regulator receiver protein  56.49 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1427  response regulator receiver protein  58.02 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0774  response regulator receiver domain-containing protein  57.25 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1694  response regulator receiver domain-containing protein  53.08 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978146  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1649  response regulator receiver protein  51.54 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.110887  normal  0.355464 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0805  response regulator receiver protein  49.62 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00141672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1327  response regulator receiver protein  46.56 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3528  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0226  response regulator receiver protein  50 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0617  response regulator receiver protein  45.04 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0355  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000313878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0375  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0684  chemotaxis protein CheY  37.98 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0863  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1975  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2249  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0876  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4540  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2590  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  36.89 
 
 		 676 aa  70.5  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 932 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 745 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03688  Stress response regulator SrrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0P7]  34.38 
 
 		 558 aa  67.4  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.13 
 
 		 703 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6863  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 497 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  40 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  36.22 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.01 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  36.22 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  37.01 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 1713 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 752 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 1003 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  34.11 
 
 		 2312 aa  64.3  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 372 aa  63.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3976  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 500 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.833176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2832  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 248 aa  64.3  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.220444  hitchhiker  0.00935314 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 887 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 649 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.08 
 
 		 575 aa  62.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  34.38 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  36.72 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 994 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 1054 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0561  CheY  32.28 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0997378  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 890 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00434081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1433 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 645 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 1680 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  32.52 
 
 		 650 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 782 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.72 
 
 		 225 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  30.77 
 
 		 568 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0692  CheY  33.33 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0775756  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.72 
 
 		 225 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 818 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  36.72 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 647 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0265  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 1383 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1791 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 234 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4186  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.6 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.24384  normal  0.790942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4667  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.07 
 
 		 495 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387828  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.94 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.94 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3708  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.6 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.94 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  30.99 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 962 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3227  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.6 
 
 		 231 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303749  normal  0.0627816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4108  diguanylate cyclase  31.06 
 
 		 320 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.87577  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 237 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4076  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.6 
 
 		 231 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105833  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4290  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.6 
 
 		 231 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01800  Two-component system protein B Precursor (EC 2.7.13.3)(Protein NHK1)(SLN1 homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P4U6]  29.69 
 
 		 1065 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  32.23 
 
 		 588 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1729  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.6 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1313 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 1691 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  34.13 
 
 		 891 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3080  histidine kinase  32.54 
 
 		 1088 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169759  normal  0.77184 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5320  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 903 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>