More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2590 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2590  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  259  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1742  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000010553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1427  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1286  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 		 131 aa  88.6  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0805  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00141672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1975  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0617  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1327  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2249  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2431  response regulator receiver domain-containing protein  34.35 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2860  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0539  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0774  response regulator receiver domain-containing protein  31.82 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3528  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178866  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0265  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 636 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0863  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3454  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1649  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.110887  normal  0.355464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  36.59 
 
 		 650 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  36.72 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 224 aa  62  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 757 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  37.4 
 
 		 225 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1694  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978146  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 225 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  34.4 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0732  cell cycle transcriptional regulator  32.81 
 
 		 256 aa  60.8  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14110  response regulator of citrate/malate metabolism  38.52 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0325971  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  39.2 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  35.2 
 
 		 229 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  35.2 
 
 		 229 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  35.2 
 
 		 229 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  35.2 
 
 		 229 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  35.2 
 
 		 229 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  35.2 
 
 		 229 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  35.2 
 
 		 229 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  38.1 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  35.2 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  41.27 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  29.69 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  38.1 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0781  hypothetical protein  33.83 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0752  hypothetical protein  35.16 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0528  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.65 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1510  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  39.2 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.8 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2757  response regulator receiver  32.79 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  35.25 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  35.25 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  34.92 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  37.3 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0708  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.4 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328024  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  35.25 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  38.35 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  38.4 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.8 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0375  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  34.09 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4432  two component transcriptional regulator  35.66 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  35.71 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  38.4 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  36.8 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  33.6 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 224 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  33.6 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 221 aa  57  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  33.6 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 		 812 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  33.6 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  33.6 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  36.92 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.71 
 
 		 225 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4040  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.88 
 
 		 232 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  34.43 
 
 		 227 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2085  two component transcriptional regulator  34.13 
 
 		 224 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 229 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4540  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2066  two component transcriptional regulator  34.13 
 
 		 224 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1675  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.1 
 
 		 226 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 752 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6011  two component transcriptional regulator  34.13 
 
 		 224 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1337  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 754 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1614  two component transcriptional regulator  32.28 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3413  two component transcriptional regulator  36.72 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9846  two component response regulator  29.37 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.75 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  35.2 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>