More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2757 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2757  response regulator receiver  100 
 
 		 225 aa  460  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  47.11 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 227 aa  208  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.12 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  46.9 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  46.9 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.89 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.64 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  46.15 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.98 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 255 aa  204  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.56 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  46.9 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  46.46 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  46.9 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  46.9 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  46.9 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  47.32 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  46.46 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  46.46 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  48 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  47.09 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  46.46 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2201  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.35 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  46.9 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.64 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.79 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  45.61 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  48.21 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2725  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.77 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.9 
 
 		 242 aa  197  9e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 232 aa  197  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  46.43 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  45.5 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.78 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.78 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.32 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2490  heavy metal response regulator  47.09 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  46.85 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  44.14 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  44.14 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  44.14 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  44.14 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  44.14 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  44.14 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  44.14 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.33 
 
 		 228 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.33 
 
 		 228 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.33 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.4 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0376  DNA-binding response regulator IrlR  43.69 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.083776  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  44.14 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4389  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1510  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2234  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.56 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  45.29 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1103  DNA-binding response regulator IrlR  43.69 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0630149  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 241 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2869  transcriptional activator protein IrlR  43.69 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.354021  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2716  DNA-binding heavy metal response regulator  43.69 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>