More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3528 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3528  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0805  response regulator receiver protein  64.62 
 
 		 136 aa  180  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00141672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0617  response regulator receiver protein  62.31 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1327  response regulator receiver protein  60.77 
 
 		 131 aa  168  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0539  response regulator receiver protein  48.85 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2860  response regulator receiver protein  49.62 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1427  response regulator receiver protein  51.15 
 
 		 131 aa  139  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0774  response regulator receiver domain-containing protein  50.78 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1286  chemotaxis protein CheY  48.85 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2431  response regulator receiver domain-containing protein  52.07 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4540  response regulator receiver protein  44.88 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1742  response regulator receiver protein  47.33 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000010553  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1649  response regulator receiver protein  47.66 
 
 		 137 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.110887  normal  0.355464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1694  response regulator receiver domain-containing protein  45.69 
 
 		 137 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0684  chemotaxis protein CheY  43.08 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0226  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0863  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0375  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2249  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 131 aa  90.9  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1975  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0355  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000313878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  36.22 
 
 		 891 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2590  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 1713 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 1116 aa  70.5  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1691 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2642  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431701  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04818  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06140)  35.11 
 
 		 1243 aa  68.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.25404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0265  response regulator receiver protein  35.79 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  30.4 
 
 		 2312 aa  66.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01800  Two-component system protein B Precursor (EC 2.7.13.3)(Protein NHK1)(SLN1 homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P4U6]  30.23 
 
 		 1065 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 1313 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 745 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2175  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 395 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924768  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 612 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 1791 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 1680 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 1064 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0537  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 957 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  34.88 
 
 		 828 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 685 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  32.8 
 
 		 1346 aa  63.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1265  sensor histidine kinase/response regulator  34.19 
 
 		 445 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0522  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  33.58 
 
 		 571 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  35.65 
 
 		 229 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.12 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  37.39 
 
 		 230 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.12 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  37.93 
 
 		 513 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  33.58 
 
 		 571 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  32.03 
 
 		 221 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3454  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.06 
 
 		 223 aa  63.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  33.59 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 1054 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84973  histidine kinase osmosensor Osmolarity two-component system protein SLN1  31.5 
 
 		 1168 aa  63.5  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.656577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0523  response regulator receiver domain-containing protein  32.54 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0876  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1075 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  29.92 
 
 		 955 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 639 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0796  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.952711  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 911 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  31.2 
 
 		 765 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 911 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 574 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  33.87 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 636 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 1285 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  30.95 
 
 		 588 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  32.26 
 
 		 1070 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  35.61 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2201  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  32.06 
 
 		 227 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.13 
 
 		 593 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.85 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.13 
 
 		 593 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  31.01 
 
 		 513 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  37.39 
 
 		 734 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1510  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 374 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 374 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 973 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.16 
 
 		 575 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  29.6 
 
 		 1643 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 801 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  34.85 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  31.06 
 
 		 334 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50403  diatom histidine kinase 1  30.83 
 
 		 883 aa  61.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  27.78 
 
 		 979 aa  60.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>