More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0876 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0876  response regulator receiver protein  100 
 
 		 151 aa  313  5e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0774  response regulator receiver domain-containing protein  35.66 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2431  response regulator receiver domain-containing protein  34.11 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1286  chemotaxis protein CheY  34.11 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2860  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0539  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1694  response regulator receiver domain-containing protein  32.82 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978146  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1649  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.110887  normal  0.355464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0375  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1742  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000010553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 645 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0805  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00141672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0863  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2249  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1327  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0241  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_137  DNA-binding response regulator  38.4 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0130  response regulator  39.66 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0355  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000313878 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0246  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.14 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0272164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0617  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086326 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3528  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178866  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1427  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1975  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 734 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  39.32 
 
 		 231 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  39.32 
 
 		 231 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 224 aa  70.5  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1265  sensor histidine kinase/response regulator  36.22 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  32 
 
 		 1347 aa  69.7  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 1054 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0200  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00404304  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  37.6 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 452 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  34.68 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  33.87 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  34.68 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.09 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 1791 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 929 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  33.87 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0623  DNA-binding response regulator  33.87 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0213  DNA-binding response regulator  32.23 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  37.01 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0254  DNA-binding response regulator  32.23 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000466037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  33.6 
 
 		 1334 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4716  DNA-binding response regulator  33.87 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.81 
 
 		 310 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  33.87 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  33.87 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  33.87 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  33.87 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  37.21 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 679 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  33.87 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.58 
 
 		 243 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.58 
 
 		 243 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0335  two component transcriptional regulator  32.84 
 
 		 222 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000018466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 225 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 225 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 225 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  35.16 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  36.51 
 
 		 563 aa  66.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0072  putative sensor/response hybrid  35.59 
 
 		 527 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111636 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0687  DNA-binding response regulator  33.87 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 1691 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03688  Stress response regulator SrrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0P7]  33.1 
 
 		 558 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 1066 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  33.06 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0562  response regulator  33.06 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 868 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  33.09 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  33.87 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  37.12 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>