More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5320 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5320  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 903 aa  1807    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.58 
 
 		 1069 aa  363  7.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 		 832 aa  352  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.09 
 
 		 1120 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 973 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 969 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 		 524 aa  295  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 		 1121 aa  290  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 		 687 aa  289  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  38.09 
 
 		 1763 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 969 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 		 1122 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  30.8 
 
 		 1111 aa  285  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 1659 aa  283  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 		 1118 aa  283  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 		 1158 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 1118 aa  281  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 1124 aa  279  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1611 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 1767 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 1767 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 		 1132 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1578 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1767 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1433 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 901 aa  274  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135172  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 1070 aa  275  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 1771 aa  274  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 903 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  40.87 
 
 		 900 aa  273  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 1157 aa  273  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 1059 aa  273  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 		 785 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 		 1626 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 674 aa  270  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  29.96 
 
 		 1141 aa  269  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 765 aa  269  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1350 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 1629 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  38.7 
 
 		 1125 aa  268  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 873 aa  267  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  36.71 
 
 		 1417 aa  267  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 		 1125 aa  267  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 873 aa  266  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 738 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1625 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 		 803 aa  265  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  32.73 
 
 		 1765 aa  265  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 		 1143 aa  265  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 		 1611 aa  264  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1629 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1632 aa  263  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 1596 aa  263  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 		 1287 aa  263  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 865 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 		 1362 aa  262  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 		 1193 aa  262  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 		 1193 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 		 1768 aa  261  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  36.17 
 
 		 1418 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 1127 aa  261  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  38.95 
 
 		 968 aa  260  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 		 896 aa  260  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 		 874 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.07 
 
 		 982 aa  259  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  39.01 
 
 		 1560 aa  257  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4802  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 910 aa  257  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 1234 aa  256  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 		 1120 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  40.98 
 
 		 661 aa  255  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1236 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 1009 aa  255  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1236 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1550 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1236 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.2 
 
 		 850 aa  254  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 		 880 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3743  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.07 
 
 		 724 aa  253  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.3347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  40.77 
 
 		 1023 aa  253  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 864 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  32.37 
 
 		 1188 aa  253  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  44.42 
 
 		 737 aa  252  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 		 1223 aa  251  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 1582 aa  251  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 984 aa  250  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 1027 aa  250  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 869 aa  250  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 893 aa  250  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 1765 aa  250  9e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1023 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 		 579 aa  249  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  33.92 
 
 		 853 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 647 aa  249  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.3 
 
 		 827 aa  249  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  32.68 
 
 		 1179 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.42 
 
 		 1255 aa  248  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 1202 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.15 
 
 		 777 aa  248  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 916 aa  248  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 1222 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>