101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0894 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
374 aa  765    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 
372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 
372 aa  438  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 
372 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
348 aa  243  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
361 aa  239  5e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 
352 aa  223  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
338 aa  219  8.999999999999998e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  37.7 
 
 
349 aa  218  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
325 aa  209  9e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
317 aa  192  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
345 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 
315 aa  185  9e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 
317 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
311 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
309 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 
317 aa  176  5e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
309 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 
328 aa  170  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
313 aa  169  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 
345 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 
326 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 
331 aa  159  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
317 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
316 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
336 aa  155  8e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
319 aa  155  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
314 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  32.07 
 
 
791 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  30.14 
 
 
824 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  28.66 
 
 
397 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.31 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  28.41 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.89 
 
 
341 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.96 
 
 
356 aa  60.5  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.96 
 
 
356 aa  60.5  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 
383 aa  57.4  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 
386 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.67 
 
 
340 aa  54.7  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
358 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
374 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 
358 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 
342 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
358 aa  53.5  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  26 
 
 
386 aa  53.1  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.56 
 
 
341 aa  53.1  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 
357 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 
374 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
401 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.12 
 
 
352 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.56 
 
 
341 aa  50.4  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 
398 aa  50.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  26 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  24.16 
 
 
407 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 
360 aa  48.9  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1280  tyrosyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.703778  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  37.35 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 
352 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0720  tyrosyl-tRNA synthetase  25 
 
 
399 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0618  tyrosyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
400 aa  47  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  25.46 
 
 
401 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46284  mitochondrial tryptophanyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 
379 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.9476  normal  0.247243 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  25.46 
 
 
401 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0499  tyrosyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 
402 aa  46.6  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.349459  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0900  tyrosyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 
415 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
435 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1407  tyrosyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1287  tyrosyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000394175  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.38 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.55 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0166  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.737336  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl192  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00755732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.36 
 
 
435 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0454  tyrosyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000282081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3900  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 
343 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.93635  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.1 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0425  tyrosyl-tRNA synthetase  23.44 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 
337 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12310  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.56 
 
 
358 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.846679  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0648  tyrosyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 
402 aa  43.5  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  22.22 
 
 
402 aa  43.1  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17561  tyrosyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 
415 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0484  tyrosyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 
401 aa  42.7  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 
333 aa  43.1  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3111  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 
326 aa  43.1  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  hitchhiker  0.0000131467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>