More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12310 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_12310  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
358 aa  734    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.846679  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06710  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.44 
 
 
362 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1393  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.55 
 
 
363 aa  427  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1317  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 
348 aa  422  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0172213  normal  0.0239999 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.46 
 
 
349 aa  423  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  58.99 
 
 
363 aa  423  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1340  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 
410 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1867  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 
370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.705084  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0653  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.31 
 
 
349 aa  405  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4636  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 
354 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.0639753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3900  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.7 
 
 
343 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.93635  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1781  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000215592  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
333 aa  278  9e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
337 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  45.32 
 
 
342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.57 
 
 
341 aa  233  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  42.55 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.49 
 
 
346 aa  233  5e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.01 
 
 
340 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
340 aa  229  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
335 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.54 
 
 
339 aa  229  7e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
335 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
331 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.4 
 
 
341 aa  228  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
323 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
342 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.72 
 
 
366 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.48 
 
 
340 aa  224  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.07 
 
 
346 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
323 aa  222  9e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.07 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.07 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.07 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.07 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.07 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.07 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.34 
 
 
357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
340 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
323 aa  219  5e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
327 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
327 aa  215  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.99 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.82 
 
 
335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.32 
 
 
339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 
327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
330 aa  212  5.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
359 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
329 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
340 aa  210  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.25 
 
 
341 aa  210  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
340 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
324 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0512  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.77 
 
 
346 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
354 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.19 
 
 
342 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
384 aa  207  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.57 
 
 
342 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 
329 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003890  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
340 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
329 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
351 aa  206  7e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
328 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
330 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
329 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
327 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4762  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.8 
 
 
337 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.586002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
352 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1026  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.48 
 
 
345 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
339 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
330 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2364  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.05 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4909  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.8 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.229127  normal  0.0358583 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4912  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.8 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4838  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.8 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01774  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.51 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4862  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.8 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.217158 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5680  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.41 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  normal  0.353927 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6431  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.41 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
328 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7076  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.14 
 
 
337 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478137 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6975  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.59 
 
 
337 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.29 
 
 
337 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6416  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.29 
 
 
337 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
329 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0485  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.17 
 
 
334 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 
346 aa  192  5e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
337 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
346 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
335 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
352 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>