More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2485 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
340 aa  709    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  76.18 
 
 
340 aa  557  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.65 
 
 
354 aa  547  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.82 
 
 
348 aa  541  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  75 
 
 
340 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.71 
 
 
342 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.88 
 
 
340 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 
329 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
329 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
359 aa  332  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 
330 aa  329  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
327 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 
327 aa  324  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
327 aa  322  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
329 aa  322  8e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
337 aa  319  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
327 aa  316  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 
324 aa  310  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
326 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
330 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  46.65 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
328 aa  300  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
328 aa  300  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
323 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
331 aa  297  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
326 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
325 aa  290  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
327 aa  290  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
329 aa  288  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
330 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
404 aa  288  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
331 aa  288  1e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
331 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
329 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
405 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
327 aa  280  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
400 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
332 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
330 aa  273  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
335 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
330 aa  271  9e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
327 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
400 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
352 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
404 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
405 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
400 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
400 aa  255  7e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.77 
 
 
346 aa  253  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
356 aa  249  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
356 aa  249  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
405 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
373 aa  249  4e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.27 
 
 
342 aa  249  5e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
333 aa  248  8e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
346 aa  248  1e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 
400 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
400 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.79 
 
 
341 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
400 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
404 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
400 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
400 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
400 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
400 aa  242  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
400 aa  242  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
400 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
351 aa  239  4e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
406 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
400 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
391 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.07 
 
 
340 aa  236  4e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.74 
 
 
340 aa  236  6e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.56 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.06 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.07 
 
 
346 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.77 
 
 
346 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>