More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5403 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.5 
 
 		 400 aa  689    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  84.25 
 
 		 400 aa  724    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  97.5 
 
 		 400 aa  815    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  83 
 
 		 400 aa  714    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  97.5 
 
 		 400 aa  815    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.75 
 
 		 400 aa  697    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  97.5 
 
 		 400 aa  815    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  96.75 
 
 		 400 aa  814    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  97.5 
 
 		 400 aa  815    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 400 aa  831    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  98.5 
 
 		 400 aa  822    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  96 
 
 		 400 aa  810    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  97.75 
 
 		 400 aa  818    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  97.5 
 
 		 400 aa  815    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  97.5 
 
 		 400 aa  815    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  99.5 
 
 		 400 aa  828    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.25 
 
 		 400 aa  657    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  84 
 
 		 400 aa  723    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  99.25 
 
 		 400 aa  827    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  97.5 
 
 		 400 aa  813    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  97.7 
 
 		 391 aa  795    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  97.5 
 
 		 400 aa  815    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  92 
 
 		 400 aa  781    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  99.5 
 
 		 400 aa  828    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.5 
 
 		 400 aa  630  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.25 
 
 		 400 aa  616  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 		 405 aa  594  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.19 
 
 		 405 aa  596  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.17 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.16 
 
 		 404 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.23 
 
 		 405 aa  568  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.39 
 
 		 406 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.04 
 
 		 404 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.37 
 
 		 404 aa  537  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.37 
 
 		 404 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.4 
 
 		 402 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.76 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 359 aa  342  7e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 325 aa  276  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 329 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.59 
 
 		 330 aa  265  8e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 328 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 		 327 aa  259  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 327 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 329 aa  254  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 329 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 330 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 		 330 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.89 
 
 		 332 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.71 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 329 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.64 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 329 aa  227  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 331 aa  219  6e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 327 aa  212  7.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 323 aa  206  8e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  33.5 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 348 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 		 336 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 342 aa  193  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 		 336 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 356 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 356 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 		 355 aa  192  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 335 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 339 aa  190  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 348 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 332 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>