More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1602 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
333 aa  691    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 
346 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 
339 aa  408  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
330 aa  309  4e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
329 aa  296  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
327 aa  292  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
325 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
323 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
329 aa  275  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
323 aa  271  8.000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
329 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
323 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
329 aa  266  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
327 aa  265  7e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
330 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
325 aa  262  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
331 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
329 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
329 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
330 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
326 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
329 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
326 aa  256  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
336 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
340 aa  251  9.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
330 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
330 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
331 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
354 aa  249  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
400 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
340 aa  248  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
332 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
327 aa  248  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
324 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
331 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
337 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
327 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
355 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  42.73 
 
 
342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
333 aa  241  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
328 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
328 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  41.27 
 
 
331 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
340 aa  239  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
327 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
336 aa  238  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
337 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
400 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
337 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
350 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
327 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  45 
 
 
346 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  45 
 
 
341 aa  235  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
342 aa  233  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0797  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
353 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 
330 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
321 aa  231  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
349 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
348 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
331 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
337 aa  230  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
331 aa  230  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
347 aa  229  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
339 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
328 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
344 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
346 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
350 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
340 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  38.27 
 
 
360 aa  227  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
335 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
350 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
336 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
338 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
346 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
346 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
347 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
347 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
338 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
346 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>