More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1608 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
339 aa  693    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.2 
 
 
346 aa  531  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 
333 aa  408  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
325 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
329 aa  280  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
327 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
330 aa  267  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
323 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
329 aa  267  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
323 aa  264  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
323 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
331 aa  260  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
326 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
327 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 
340 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
324 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
330 aa  239  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
405 aa  238  8e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
324 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
330 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
327 aa  237  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
330 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
331 aa  236  4e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.39 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
329 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
341 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
327 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
330 aa  231  9e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
325 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
321 aa  230  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
355 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
348 aa  230  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
335 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
333 aa  230  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1263  Tryptophan--tRNA ligase  43.71 
 
 
334 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
340 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  38.55 
 
 
360 aa  228  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.91 
 
 
340 aa  228  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
329 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
321 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
344 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
324 aa  227  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
338 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
346 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
339 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
329 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
346 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
333 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  40.29 
 
 
342 aa  226  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
346 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
337 aa  226  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
346 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
321 aa  226  6e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
330 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
327 aa  225  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
321 aa  225  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
335 aa  225  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
331 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
337 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
338 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
348 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
327 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
340 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
319 aa  224  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
346 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
325 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
327 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
331 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.51 
 
 
341 aa  222  6e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
340 aa  222  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
332 aa  222  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
350 aa  222  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.76 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.72 
 
 
346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.72 
 
 
346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.72 
 
 
346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.72 
 
 
346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.72 
 
 
346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.72 
 
 
346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.72 
 
 
346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>