More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0935 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 346 aa  711    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.2 
 
 		 339 aa  531  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 331 aa  252  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 359 aa  248  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 344 aa  245  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 346 aa  242  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 326 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 344 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 346 aa  232  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 329 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 351 aa  229  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 329 aa  228  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.09 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 327 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4257  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 321 aa  226  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 332 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 321 aa  226  7e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 327 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 350 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1263  Tryptophan--tRNA ligase  43.41 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4204  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.88 
 
 		 346 aa  223  4e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 319 aa  222  6e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 319 aa  223  6e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 329 aa  222  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 342 aa  222  9e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>