More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0588 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 321 aa  666    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.93 
 
 		 325 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 		 321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 319 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 321 aa  394  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 319 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 319 aa  391  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 319 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 324 aa  384  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.62 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 325 aa  371  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 321 aa  359  4e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 324 aa  325  6e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 322 aa  298  9e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 322 aa  291  9e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 353 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 443 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  47.65 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 430 aa  278  9e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 435 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 361 aa  275  6e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 341 aa  275  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 435 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 439 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 448 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 434 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 455 aa  262  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 434 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 331 aa  255  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 436 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 448 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 448 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 332 aa  249  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 449 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 449 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 434 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 449 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 453 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 435 aa  245  6e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 451 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 449 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 327 aa  228  9e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 339 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 333 aa  225  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 339 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0949  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0670  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167937 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 333 aa  222  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 336 aa  222  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>