More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1002 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 322 aa  668    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.94 
 
 		 322 aa  429  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 324 aa  428  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.3 
 
 		 325 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 325 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  59.63 
 
 		 322 aa  395  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 321 aa  315  5e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 321 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 323 aa  302  4.0000000000000003e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 321 aa  298  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 324 aa  295  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 449 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 321 aa  295  1e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 435 aa  287  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 448 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 341 aa  285  7e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 434 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 319 aa  279  5e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 332 aa  279  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 429 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 332 aa  276  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 362 aa  275  5e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 321 aa  275  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 435 aa  271  9e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 332 aa  269  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 332 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 449 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 453 aa  266  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 449 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 449 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 448 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 449 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 451 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 325 aa  255  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 449 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 333 aa  196  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 332 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 332 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 332 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 347 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>