More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0894 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.91 
 
 		 449 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  76.56 
 
 		 449 aa  689    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  76.56 
 
 		 449 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.5 
 
 		 451 aa  694    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.46 
 
 		 449 aa  702    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 448 aa  914    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.69 
 
 		 448 aa  701    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  80.13 
 
 		 449 aa  715    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.57 
 
 		 448 aa  699    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.29 
 
 		 453 aa  692    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.91 
 
 		 449 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.83 
 
 		 435 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 		 436 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.25 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.33 
 
 		 449 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.91 
 
 		 435 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 455 aa  491  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.15 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 430 aa  461  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 434 aa  457  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.78 
 
 		 337 aa  441  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.94 
 
 		 335 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.11 
 
 		 334 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 365 aa  402  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 361 aa  398  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 332 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 332 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 332 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 332 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 332 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 332 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 332 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 332 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 332 aa  341  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 341 aa  341  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 341 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 331 aa  335  7e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 353 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 335 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 322 aa  289  7e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 322 aa  282  8.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 324 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 319 aa  264  3e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 321 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 321 aa  260  4e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 321 aa  257  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 321 aa  257  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  43.03 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 325 aa  248  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 325 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 319 aa  233  5e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 324 aa  220  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 327 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1768  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 347 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 346 aa  193  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 331 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 347 aa  192  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 347 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 348 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 329 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 329 aa  189  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 347 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 335 aa  187  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  36.39 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25860  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 342 aa  183  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.986155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6886  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.447251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>