More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0405 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 324 aa  663    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.12 
 
 		 324 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 321 aa  328  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 321 aa  325  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 319 aa  324  1e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 321 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 331 aa  319  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 325 aa  316  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 319 aa  308  9e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 323 aa  302  5.000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 319 aa  297  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 324 aa  268  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  45.31 
 
 		 322 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 322 aa  265  7e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 322 aa  258  9e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 443 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 329 aa  249  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 341 aa  248  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 449 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 353 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 430 aa  239  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 448 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 435 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 361 aa  236  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 434 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 432 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 434 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 449 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 434 aa  230  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 449 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 449 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 332 aa  228  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 435 aa  228  8e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 449 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 453 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 449 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 355 aa  225  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 449 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 339 aa  225  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 330 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 338 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 336 aa  222  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>