More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1811 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 434 aa  887    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  98.62 
 
 		 435 aa  872    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.19 
 
 		 429 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.89 
 
 		 430 aa  596  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.7 
 
 		 430 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.25 
 
 		 434 aa  534  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.25 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.16 
 
 		 443 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.35 
 
 		 435 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.93 
 
 		 432 aa  521  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.16 
 
 		 439 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.07 
 
 		 449 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.16 
 
 		 435 aa  498  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 		 455 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 448 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.44 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.95 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 436 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.44 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 449 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.76 
 
 		 451 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 		 338 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 337 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 337 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.06 
 
 		 335 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 		 334 aa  361  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 331 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 332 aa  322  6e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 332 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 332 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 332 aa  318  9e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 332 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 332 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 332 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 332 aa  317  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 336 aa  315  7e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 335 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 322 aa  278  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 322 aa  276  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 324 aa  262  8e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 324 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 325 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 325 aa  259  9e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 323 aa  249  8e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 321 aa  249  9e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 319 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 321 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  45.07 
 
 		 322 aa  247  4e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 325 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 319 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 325 aa  240  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 319 aa  237  3e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 321 aa  236  8e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 321 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 325 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 319 aa  213  7.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 330 aa  202  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 328 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 333 aa  193  6e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 327 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2580  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 332 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.804405 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 328 aa  187  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 328 aa  187  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1768  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 347 aa  186  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 339 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_002950  PG2085  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 327 aa  182  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 332 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6886  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.447251 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 331 aa  180  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 327 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 332 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 334 aa  179  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 327 aa  179  8e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>