More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0588 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 339 aa  695    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.93 
 
 		 331 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.08 
 
 		 332 aa  471  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 335 aa  431  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.42 
 
 		 332 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 		 348 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.23 
 
 		 353 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 350 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.23 
 
 		 353 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 		 345 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 344 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 347 aa  408  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.31 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.1 
 
 		 357 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.36 
 
 		 347 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 		 342 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.1 
 
 		 347 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.65 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 339 aa  391  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 354 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.72 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0026  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 354 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606354  normal  0.463115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1020  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.74 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 331 aa  355  3.9999999999999996e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 355 aa  342  5e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 337 aa  335  7e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 335 aa  335  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 336 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 336 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 336 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 335 aa  322  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 337 aa  318  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 332 aa  316  3e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 337 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 337 aa  311  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 336 aa  311  9e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 332 aa  309  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 345 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 332 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 332 aa  305  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 348 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 332 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4257  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  44.35 
 
 		 342 aa  299  5e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00502  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 335 aa  298  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  45.22 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 346 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 346 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 346 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 334 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 333 aa  295  6e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 339 aa  295  8e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 339 aa  293  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 328 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 332 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 332 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 333 aa  292  6e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>