More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2965 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
337 aa  703    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.77 
 
 
338 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.26 
 
 
337 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.96 
 
 
334 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.6 
 
 
335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.17 
 
 
435 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.66 
 
 
435 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.77 
 
 
434 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.66 
 
 
432 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.25 
 
 
448 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.76 
 
 
430 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 
449 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 
434 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 
455 aa  425  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 
439 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.88 
 
 
449 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.72 
 
 
451 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.18 
 
 
449 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.54 
 
 
429 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
449 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.78 
 
 
448 aa  418  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 
430 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.69 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 
449 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.99 
 
 
449 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 
448 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 
443 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.88 
 
 
453 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 
436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.52 
 
 
365 aa  403  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 
434 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.44 
 
 
361 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 
362 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 
331 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
332 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
332 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 
332 aa  349  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
332 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
332 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 
332 aa  346  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 
332 aa  346  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
332 aa  345  7e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
332 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 
332 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
341 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 
341 aa  331  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
336 aa  328  6e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
335 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
324 aa  295  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
322 aa  293  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
319 aa  286  5e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
319 aa  285  9e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
319 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
325 aa  279  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
325 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
321 aa  269  5e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
321 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
323 aa  258  1e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  42.55 
 
 
322 aa  255  7e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
324 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
321 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
321 aa  248  9e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
321 aa  247  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
325 aa  246  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
325 aa  241  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
325 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
331 aa  235  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 
324 aa  229  8e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
329 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
327 aa  198  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6886  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
334 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.447251 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
329 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
329 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
336 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
330 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
357 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
329 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 
329 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
330 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
332 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
332 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
332 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
332 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
341 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
331 aa  187  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 
332 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 
335 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>