More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0990 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 324 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.67 
 
 		 322 aa  519  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.67 
 
 		 322 aa  511  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 322 aa  428  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 325 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.04 
 
 		 325 aa  371  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  54.04 
 
 		 322 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 324 aa  301  8.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 337 aa  298  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 337 aa  295  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 319 aa  290  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 319 aa  288  6e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 323 aa  287  1e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 439 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 319 aa  279  4e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 449 aa  278  9e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 443 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 448 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 434 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 435 aa  271  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 434 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 324 aa  268  8e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 365 aa  268  8.999999999999999e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 436 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 435 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 432 aa  266  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 332 aa  265  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 341 aa  263  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 430 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 434 aa  262  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 332 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 332 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 332 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 341 aa  261  8e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 332 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 448 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 435 aa  258  7e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 335 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 335 aa  258  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 430 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 453 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 455 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 449 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 448 aa  254  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 449 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 449 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 429 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 449 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 331 aa  208  9e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 346 aa  206  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 327 aa  202  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1768  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 347 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04760  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.970086  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 338 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>