More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02854 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.49 
 
 		 435 aa  639    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.42 
 
 		 430 aa  649    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 429 aa  875    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.19 
 
 		 434 aa  640    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.2 
 
 		 432 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.83 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.49 
 
 		 430 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.95 
 
 		 435 aa  551  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.51 
 
 		 443 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.41 
 
 		 434 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.16 
 
 		 434 aa  549  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.25 
 
 		 449 aa  537  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.66 
 
 		 455 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 435 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 		 448 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 448 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 436 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 448 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.81 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 449 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 451 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 449 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.31 
 
 		 449 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.54 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.42 
 
 		 335 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.06 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 		 337 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 334 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 332 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 332 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 332 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 332 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 332 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 332 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 332 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 332 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 332 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 332 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 331 aa  328  8e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 353 aa  322  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 336 aa  319  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 341 aa  318  7.999999999999999e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 341 aa  318  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 322 aa  277  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 324 aa  266  7e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 325 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  43.16 
 
 		 322 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 321 aa  253  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 324 aa  253  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 321 aa  252  9.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 321 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 319 aa  238  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 323 aa  238  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 324 aa  236  7e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 319 aa  233  5e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 319 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 321 aa  223  7e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 321 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 321 aa  219  6e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 325 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 319 aa  210  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 328 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 333 aa  196  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 336 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 330 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 330 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6886  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 334 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.447251 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2085  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 346 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 341 aa  189  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04760  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.970086  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 328 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 328 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2580  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 332 aa  182  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.804405 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 329 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 327 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 339 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 328 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>