More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0443 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 342 aa  712    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  76.35 
 
 		 341 aa  556  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.27 
 
 		 341 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.29 
 
 		 347 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.99 
 
 		 357 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.69 
 
 		 357 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.66 
 
 		 339 aa  490  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.84 
 
 		 353 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.37 
 
 		 354 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.26 
 
 		 332 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.02 
 
 		 354 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.98 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.16 
 
 		 350 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.83 
 
 		 348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.45 
 
 		 335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.62 
 
 		 347 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.08 
 
 		 347 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.45 
 
 		 349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.11 
 
 		 355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.05 
 
 		 344 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.79 
 
 		 347 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.72 
 
 		 350 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.08 
 
 		 355 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.54 
 
 		 350 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 354 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.62 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.29 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.36 
 
 		 354 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0026  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.8 
 
 		 354 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606354  normal  0.463115 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 		 356 aa  420  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.21 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 		 344 aa  411  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 331 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 		 332 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.36 
 
 		 331 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1020  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 355 aa  317  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 336 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 328 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 337 aa  297  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 335 aa  296  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 327 aa  295  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  45.13 
 
 		 342 aa  294  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 338 aa  292  6e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 339 aa  289  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 334 aa  289  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 334 aa  289  6e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 329 aa  289  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04760  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 360 aa  288  8e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.970086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 329 aa  285  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 346 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 346 aa  285  8e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 334 aa  285  8e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 329 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 337 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 329 aa  281  9e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>