More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2912 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 325 aa  675    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.62 
 
 		 325 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 322 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 		 322 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 		 322 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  56.48 
 
 		 322 aa  363  2e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 324 aa  311  6.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 321 aa  285  5.999999999999999e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 337 aa  279  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 448 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 341 aa  262  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 324 aa  262  6e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 439 aa  261  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 443 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 429 aa  259  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 434 aa  259  6e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 435 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 432 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 435 aa  256  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 331 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 332 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 335 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 331 aa  252  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 332 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 332 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 434 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 430 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 448 aa  248  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 448 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 453 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 455 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 319 aa  242  7e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 449 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 449 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 449 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 436 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 449 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 449 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 449 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 451 aa  231  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 335 aa  209  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 339 aa  195  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 338 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 355 aa  192  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 336 aa  192  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 346 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 328 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>