More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1411 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
336 aa  699    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.31 
 
 
333 aa  447  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.7 
 
 
332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 
332 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 
332 aa  435  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 
332 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 
332 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 
332 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 
332 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 
332 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4257  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.79 
 
 
335 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 
335 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.31 
 
 
334 aa  424  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.79 
 
 
332 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.7 
 
 
334 aa  424  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.79 
 
 
332 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.79 
 
 
332 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 
332 aa  425  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4193  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.79 
 
 
332 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 
334 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 
334 aa  421  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
346 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
346 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
346 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 
334 aa  417  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 
334 aa  417  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.1 
 
 
334 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 
334 aa  417  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.1 
 
 
334 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 
334 aa  417  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 
334 aa  417  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  56.8 
 
 
334 aa  417  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 
334 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 
334 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0246  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
332 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
332 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 
337 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 
335 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 
327 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 
336 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.04 
 
 
339 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00502  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
335 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 
333 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 
328 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
327 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
365 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
338 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
346 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 
346 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 
330 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
329 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
329 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
329 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
329 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
329 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
338 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
329 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
329 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
329 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
328 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
329 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
328 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 
329 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 
329 aa  364  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 
344 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 
344 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
345 aa  360  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
351 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
344 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 
337 aa  358  7e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
347 aa  355  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2136  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 
331 aa  354  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
341 aa  353  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
341 aa  349  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
336 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
344 aa  343  4e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25860  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
342 aa  342  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.986155  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
348 aa  341  8e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0797  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
353 aa  341  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
352 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0575  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.415055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
339 aa  339  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0815  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 
341 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
340 aa  335  7.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
340 aa  334  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
331 aa  333  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
344 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0594951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>