More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0768 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 353 aa  718    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.59 
 
 		 341 aa  574  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 		 341 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.57 
 
 		 336 aa  455  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.01 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 435 aa  346  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 365 aa  345  6e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 434 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 435 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 331 aa  339  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 434 aa  339  5e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 337 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 361 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 449 aa  332  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 332 aa  332  6e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 332 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 448 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 439 aa  328  8e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 455 aa  325  5e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 338 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 337 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 429 aa  322  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 334 aa  319  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 453 aa  316  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 335 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 449 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 435 aa  311  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 434 aa  311  9e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 449 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 449 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 430 aa  309  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 449 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 449 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 449 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 324 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 324 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 319 aa  267  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 319 aa  266  5e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 322 aa  263  4.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  45.21 
 
 		 322 aa  261  8.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 325 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 321 aa  257  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 321 aa  255  8e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 323 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 319 aa  252  8.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 331 aa  249  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 347 aa  202  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 329 aa  199  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 333 aa  199  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1768  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6886  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.447251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 337 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 329 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 330 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 328 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 329 aa  192  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 355 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>