More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1568 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 362 aa  754    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  95.3 
 
 		 361 aa  714    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  82.66 
 
 		 365 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.94 
 
 		 434 aa  424  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 		 434 aa  421  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.91 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 334 aa  408  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.3 
 
 		 335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 435 aa  401  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 449 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 448 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.1 
 
 		 453 aa  391  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 435 aa  391  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 451 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 455 aa  378  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 449 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 449 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 332 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 332 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 332 aa  353  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 331 aa  352  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 332 aa  345  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 335 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 341 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 321 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 322 aa  275  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 321 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 324 aa  266  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 319 aa  256  6e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 323 aa  250  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 		 325 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  41.19 
 
 		 322 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 321 aa  239  8e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 321 aa  235  8e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 324 aa  227  3e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 328 aa  206  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 327 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 		 329 aa  202  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 339 aa  202  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6886  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.447251 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 330 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 327 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 331 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 346 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 346 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>