More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1755 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
321 aa  663    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.6 
 
 
321 aa  464  9.999999999999999e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.56 
 
 
323 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.47 
 
 
321 aa  447  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.08 
 
 
319 aa  441  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.46 
 
 
319 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.08 
 
 
319 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.14 
 
 
319 aa  431  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  64 
 
 
325 aa  428  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.7 
 
 
319 aa  422  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 
321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 
324 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 
325 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 
321 aa  338  5e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
321 aa  333  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 
331 aa  324  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
322 aa  308  5.9999999999999995e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
322 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 
325 aa  296  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
324 aa  293  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
325 aa  285  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  47.02 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
325 aa  277  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
331 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
341 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
448 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
353 aa  255  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
443 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
430 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
332 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
332 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
332 aa  252  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
332 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
332 aa  249  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
335 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
336 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
332 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
432 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
337 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
332 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
332 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
436 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
449 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
448 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
365 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
453 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
449 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
448 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
435 aa  242  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
434 aa  242  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
449 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
361 aa  240  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
338 aa  239  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
449 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
435 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
449 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
362 aa  235  6e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
449 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
434 aa  235  9e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
449 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
334 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
439 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
435 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
335 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
346 aa  226  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
430 aa  222  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
455 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
327 aa  219  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
329 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
330 aa  210  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
336 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
327 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
330 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
329 aa  206  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
359 aa  205  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0342  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
336 aa  204  2e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.12931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
330 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
324 aa  203  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
323 aa  203  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
328 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 
325 aa  202  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 
329 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
323 aa  202  7e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0949  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
329 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
329 aa  199  5e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
348 aa  199  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>