More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2877 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
348 aa  726    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  81.47 
 
 
340 aa  596  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  80.35 
 
 
342 aa  589  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  80.59 
 
 
340 aa  585  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.1 
 
 
354 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.94 
 
 
340 aa  544  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.82 
 
 
340 aa  541  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 
329 aa  348  8e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 
329 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
329 aa  333  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
327 aa  332  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
359 aa  332  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
337 aa  325  6e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
327 aa  325  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 
333 aa  322  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
330 aa  322  7e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
325 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
327 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
328 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
325 aa  305  6e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
329 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
330 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
328 aa  300  3e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
328 aa  300  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
331 aa  299  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
331 aa  299  6e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  44.67 
 
 
331 aa  295  7e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
324 aa  295  8e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
323 aa  295  8e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
329 aa  291  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
323 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
323 aa  288  7e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
326 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
330 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
331 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
327 aa  278  7e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
331 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
335 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
335 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
330 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
330 aa  269  4e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
405 aa  265  8e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
373 aa  262  6.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
327 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.07 
 
 
340 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
356 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
356 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
404 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
404 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.4 
 
 
346 aa  245  9e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
404 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
351 aa  243  3e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.76 
 
 
341 aa  239  4e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.43 
 
 
342 aa  237  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.06 
 
 
357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.32 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
384 aa  233  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
400 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.64 
 
 
339 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
400 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
339 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.06 
 
 
342 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.06 
 
 
342 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.77 
 
 
339 aa  228  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.23 
 
 
341 aa  227  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
391 aa  227  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6975  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.47 
 
 
337 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.1 
 
 
366 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7076  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.17 
 
 
337 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478137 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5680  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.17 
 
 
337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  normal  0.353927 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6431  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.17 
 
 
337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.17 
 
 
337 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6416  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.17 
 
 
337 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3900  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
343 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.93635  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.3 
 
 
341 aa  219  6e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
355 aa  215  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
349 aa  211  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.4 
 
 
342 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  39.18 
 
 
363 aa  211  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
403 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0485  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.61 
 
 
334 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
403 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.13 
 
 
346 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.13 
 
 
346 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.13 
 
 
346 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.13 
 
 
346 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>