More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1469 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
329 aa  681    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.66 
 
 
329 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.46 
 
 
325 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 
324 aa  411  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 
330 aa  401  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 
326 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 
327 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.1 
 
 
329 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 
327 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
327 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.77 
 
 
331 aa  385  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 
327 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
327 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
328 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
359 aa  378  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 
326 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
328 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
328 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
329 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 
329 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 
329 aa  365  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 
328 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 
330 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 
340 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 
329 aa  362  4e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
333 aa  361  8e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
329 aa  360  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 
327 aa  359  3e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
331 aa  358  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
330 aa  358  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 
340 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 
348 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 
340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 
342 aa  348  8e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
340 aa  346  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
325 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
332 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  53.87 
 
 
331 aa  346  3e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 
323 aa  344  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
323 aa  340  2e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
323 aa  338  5e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
331 aa  315  6e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
373 aa  306  3e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
335 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
335 aa  296  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
352 aa  291  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
330 aa  287  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
404 aa  285  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
391 aa  281  8.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
404 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
327 aa  275  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
356 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
356 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
346 aa  267  1e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
351 aa  257  2e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.91 
 
 
402 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.15 
 
 
342 aa  256  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.63 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.86 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  45.7 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.86 
 
 
400 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.14 
 
 
400 aa  252  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.03 
 
 
346 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.03 
 
 
346 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.26 
 
 
400 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.03 
 
 
346 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.03 
 
 
346 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.14 
 
 
366 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.03 
 
 
346 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.07 
 
 
340 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.03 
 
 
346 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.03 
 
 
346 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 
400 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 
400 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.43 
 
 
346 aa  250  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 
400 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
400 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 
400 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 
406 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 
400 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  43.12 
 
 
363 aa  246  4e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.09 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>