More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0389 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 319 aa  662    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.65 
 
 		 321 aa  444  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.2 
 
 		 321 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.14 
 
 		 321 aa  431  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 319 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.32 
 
 		 319 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.32 
 
 		 319 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.62 
 
 		 323 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.13 
 
 		 319 aa  411  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.3 
 
 		 325 aa  404  1e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 325 aa  348  8e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 353 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 434 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 430 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 449 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 439 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 361 aa  226  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 332 aa  225  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 332 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 432 aa  225  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 435 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  39.5 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 448 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 		 329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 435 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 453 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 436 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 449 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 336 aa  215  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 449 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 449 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 430 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 435 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 455 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 325 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 429 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 449 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 346 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 		 448 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 449 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 449 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 336 aa  202  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 332 aa  195  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 339 aa  195  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25860  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 342 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.986155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0670  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167937 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>