More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4538 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  96.66 
 
 		 449 aa  870    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  83.3 
 
 		 449 aa  745    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 449 aa  918    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  82.63 
 
 		 449 aa  735    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  82.21 
 
 		 451 aa  711    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.46 
 
 		 448 aa  702    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  92.87 
 
 		 449 aa  838    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.28 
 
 		 453 aa  655    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.9 
 
 		 448 aa  699    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  95.77 
 
 		 449 aa  863    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.79 
 
 		 448 aa  697    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 435 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.58 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 		 432 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.93 
 
 		 449 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.25 
 
 		 439 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 		 455 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 		 430 aa  491  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.75 
 
 		 435 aa  488  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.75 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.81 
 
 		 429 aa  484  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.5 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.44 
 
 		 435 aa  480  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 443 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 		 430 aa  468  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.02 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 		 337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 		 334 aa  415  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 		 365 aa  410  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 341 aa  350  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 331 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 332 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 332 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 332 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 332 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 332 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 332 aa  338  9e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 341 aa  336  5.999999999999999e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 332 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 353 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 322 aa  283  5.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 322 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 324 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  44.85 
 
 		 322 aa  271  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 319 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 319 aa  269  8e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 325 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 322 aa  267  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 321 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 321 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 321 aa  257  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 325 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 324 aa  253  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 321 aa  252  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 321 aa  243  6e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 325 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 324 aa  240  5e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 321 aa  238  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 325 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 325 aa  233  5e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 330 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 330 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6886  tryptophanyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 334 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.447251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 336 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 		 330 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 328 aa  196  7e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 328 aa  196  7e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 333 aa  196  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 346 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 329 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 334 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 339 aa  191  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 347 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 344 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>