More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0242 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02854  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.42 
 
 		 429 aa  649    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0242  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 430 aa  876    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.607361  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1743  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.2 
 
 		 435 aa  595  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1811  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.89 
 
 		 434 aa  596  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2771  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 434 aa  548  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3438  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 434 aa  547  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0620  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.34 
 
 		 435 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4025  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 443 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5415  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.18 
 
 		 430 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1001  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.66 
 
 		 449 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757013  hitchhiker  0.000328447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3240  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3711  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.16 
 
 		 435 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3278  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.66 
 
 		 439 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.304341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1623  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4538  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 		 449 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1311  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.600947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13010  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4413  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.520891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57670  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 448 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 448 aa  441  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2640  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 436 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0918  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 449 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.435923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4123  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 449 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4429  tryptophanyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5011  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 448 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4699  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00386571  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2965  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1230  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2526  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3230  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 335 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1568  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0656784  normal  0.380715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1953  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2228  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1750  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.110682  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2370  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 331 aa  332  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 332 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3143  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 332 aa  329  7e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1873  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3376  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 332 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3053  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 332 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3353  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 332 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3159  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 332 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3408  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 332 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3378  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 332 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3081  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 332 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32570  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0378  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 335 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0459498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2376  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3963  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 341 aa  313  4.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0768  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 353 aa  309  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0510321  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1002  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 322 aa  273  5.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.325516  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03505  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 322 aa  270  4e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.368558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0423  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0990  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 324 aa  257  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2912  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0986244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1365  hypothetical protein  41.64 
 
 		 322 aa  246  6e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2109  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 321 aa  246  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0437  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1570  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 319 aa  242  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 321 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0411  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 319 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 324 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1341  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 323 aa  232  9e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0771  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 325 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0534  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 319 aa  230  4e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 331 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1755  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 321 aa  222  9e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0389  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0050  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 325 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 321 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 330 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 327 aa  202  8e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 329 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 333 aa  199  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_002950  PG2085  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 327 aa  199  9e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 331 aa  193  6e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6886  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 334 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.447251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 357 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 339 aa  186  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 348 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 329 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 346 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 325 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>