More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0142 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 327 aa  685    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 330 aa  351  8e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 323 aa  320  3e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 323 aa  320  3e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 333 aa  292  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 331 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 327 aa  281  7.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 329 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 332 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 329 aa  272  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 340 aa  267  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 339 aa  265  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 324 aa  265  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 354 aa  264  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 340 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 332 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 340 aa  261  8e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 326 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 341 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 346 aa  259  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 328 aa  258  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 330 aa  258  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 348 aa  258  9e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 329 aa  255  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 340 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 333 aa  252  8.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 340 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 331 aa  249  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0405  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 334 aa  249  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 332 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 332 aa  248  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 332 aa  248  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 329 aa  248  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 332 aa  248  9e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 334 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 334 aa  247  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  42.47 
 
 		 334 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>