More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3886 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4193  tryptophanyl-tRNA synthetase  96.69 
 
 		 332 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  99.7 
 
 		 332 aa  691    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  95.78 
 
 		 332 aa  673    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  96.39 
 
 		 332 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  96.39 
 
 		 332 aa  656    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  94.58 
 
 		 332 aa  659    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  93.07 
 
 		 332 aa  653    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  96.69 
 
 		 332 aa  658    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  99.4 
 
 		 332 aa  690    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  99.7 
 
 		 332 aa  691    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  92.17 
 
 		 332 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 332 aa  693    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  92.77 
 
 		 332 aa  628  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  91.24 
 
 		 335 aa  624  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4257  tryptophanyl-tRNA synthetase  90.91 
 
 		 335 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294699 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0246  tryptophanyl-tRNA synthetase  90.66 
 
 		 336 aa  615  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.24 
 
 		 346 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.11 
 
 		 334 aa  535  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.41 
 
 		 334 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.94 
 
 		 346 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.81 
 
 		 334 aa  534  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.24 
 
 		 346 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.41 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.02 
 
 		 334 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0456101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.72 
 
 		 334 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.72 
 
 		 334 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.72 
 
 		 334 aa  528  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.72 
 
 		 334 aa  528  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  73.72 
 
 		 334 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.41 
 
 		 334 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.41 
 
 		 334 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.41 
 
 		 334 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.41 
 
 		 334 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.41 
 
 		 334 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.41 
 
 		 334 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.41 
 
 		 334 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.41 
 
 		 334 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.11 
 
 		 334 aa  524  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.9 
 
 		 334 aa  521  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.69 
 
 		 333 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.98 
 
 		 337 aa  495  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.58 
 
 		 333 aa  487  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.26 
 
 		 338 aa  485  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00502  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.48 
 
 		 335 aa  482  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.76 
 
 		 365 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.16 
 
 		 338 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.97 
 
 		 335 aa  472  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 		 338 aa  464  9.999999999999999e-131  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.33 
 
 		 345 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 		 336 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.7 
 
 		 336 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 327 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 332 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 332 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 352 aa  358  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 351 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 346 aa  355  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 328 aa  355  5.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04760  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.970086  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 337 aa  352  7e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 344 aa  351  8e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 344 aa  351  8e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 329 aa  350  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 329 aa  349  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 329 aa  348  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 329 aa  348  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 329 aa  348  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 329 aa  348  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 329 aa  348  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 329 aa  348  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 348 aa  348  6e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 329 aa  348  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0575  tryptophanyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 329 aa  347  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.415055  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25860  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 342 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.986155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 332 aa  346  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 341 aa  345  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 329 aa  345  7e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 329 aa  345  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 344 aa  344  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0984  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 344 aa  338  8e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1294  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.52128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0797  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 353 aa  335  7.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4204  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1014  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 329 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00140566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0995  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 329 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>