More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2090 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
342 aa  713    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  80.35 
 
 
348 aa  589  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  81.76 
 
 
340 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  76.76 
 
 
340 aa  557  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.95 
 
 
354 aa  556  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.71 
 
 
340 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.76 
 
 
340 aa  537  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
329 aa  343  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
359 aa  343  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 
329 aa  329  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 
337 aa  328  8e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
327 aa  325  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 
333 aa  325  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 
327 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
327 aa  318  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
325 aa  316  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
326 aa  311  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
327 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
328 aa  309  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
328 aa  305  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
329 aa  305  6e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  46.45 
 
 
331 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
323 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
328 aa  301  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
328 aa  301  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
324 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
329 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
330 aa  299  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
323 aa  298  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
323 aa  295  8e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
332 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
329 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
331 aa  291  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
330 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
331 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
326 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
331 aa  286  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
327 aa  286  5e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
331 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
325 aa  286  5e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
405 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
330 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
335 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
329 aa  277  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
330 aa  273  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
404 aa  262  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 
356 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 
356 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
404 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.22 
 
 
346 aa  261  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
400 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
405 aa  252  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
373 aa  252  7e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.77 
 
 
340 aa  250  3e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.01 
 
 
339 aa  249  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
402 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
404 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
400 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
400 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.06 
 
 
341 aa  246  4e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
400 aa  246  6e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3900  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.93635  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
400 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
400 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
400 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
400 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
400 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
400 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
400 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
400 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
400 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.64 
 
 
342 aa  242  7e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
400 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
351 aa  239  4e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.06 
 
 
357 aa  239  6.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.9 
 
 
340 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.33 
 
 
339 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
360 aa  237  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.4 
 
 
341 aa  235  6e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
384 aa  235  7e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
391 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
355 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
400 aa  229  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12310  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
358 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.846679  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.58 
 
 
366 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.47 
 
 
342 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>