More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2236 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
340 aa  712    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  76.18 
 
 
340 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.94 
 
 
348 aa  544  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.24 
 
 
354 aa  544  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  75 
 
 
340 aa  547  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.76 
 
 
342 aa  537  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.47 
 
 
340 aa  531  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
329 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
359 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 
329 aa  345  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
329 aa  345  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
333 aa  342  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
327 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
327 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 
337 aa  332  7.000000000000001e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
326 aa  328  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  48.82 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
327 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
329 aa  322  8e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
328 aa  319  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
329 aa  318  6e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
330 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
324 aa  316  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
331 aa  311  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
328 aa  311  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
328 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
323 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
323 aa  301  9e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
323 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
329 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
326 aa  299  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
330 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
325 aa  297  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
331 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
332 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
327 aa  293  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
331 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
335 aa  282  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
405 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
335 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
400 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
327 aa  278  8e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
330 aa  278  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
352 aa  275  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
404 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
404 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
400 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
405 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
327 aa  261  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
373 aa  261  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
404 aa  260  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
400 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.4 
 
 
342 aa  256  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
356 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
356 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 
346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.79 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.33 
 
 
346 aa  253  5.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
333 aa  251  9.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
406 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
405 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
404 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.57 
 
 
339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.76 
 
 
340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
404 aa  242  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.35 
 
 
340 aa  238  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.45 
 
 
357 aa  237  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
355 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.06 
 
 
341 aa  236  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1393  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
363 aa  236  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  40.47 
 
 
363 aa  233  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.66 
 
 
366 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40 
 
 
339 aa  232  9e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
384 aa  230  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12310  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
358 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.846679  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
360 aa  229  7e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40 
 
 
346 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.7 
 
 
346 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.12 
 
 
342 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.7 
 
 
346 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.7 
 
 
346 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1867  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
370 aa  226  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.705084  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.7 
 
 
346 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.7 
 
 
346 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.7 
 
 
346 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.6 
 
 
341 aa  226  4e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3900  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
343 aa  225  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.93635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>