More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0598 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  95.56 
 
 
338 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  95.56 
 
 
338 aa  669    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
338 aa  692    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  87.39 
 
 
347 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.57 
 
 
337 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.67 
 
 
337 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.37 
 
 
337 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.86 
 
 
337 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.37 
 
 
337 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.56 
 
 
337 aa  474  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.56 
 
 
336 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 
339 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 
355 aa  434  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 
336 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 
336 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 
335 aa  425  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 
337 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.21 
 
 
335 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  51.78 
 
 
342 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  47.46 
 
 
360 aa  351  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 
348 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
327 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
336 aa  325  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
337 aa  322  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
334 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 
347 aa  319  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
336 aa  316  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
345 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
347 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
344 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
344 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
344 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
330 aa  312  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
334 aa  311  6.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
350 aa  311  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
350 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
334 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
332 aa  309  4e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
333 aa  308  5.9999999999999995e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
328 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
352 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
339 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
332 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
332 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
327 aa  305  6e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
332 aa  305  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
355 aa  305  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
341 aa  305  8.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
344 aa  305  9.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
348 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
329 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
329 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
329 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
329 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
340 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
332 aa  301  7.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
346 aa  301  8.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
334 aa  301  9e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
334 aa  301  9e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133889 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
334 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
334 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  45.29 
 
 
334 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
334 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
334 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
354 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
332 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
335 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
334 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>