More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0938 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 337 aa  694    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  89.52 
 
 		 337 aa  626  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  84.08 
 
 		 337 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.84 
 
 		 337 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.54 
 
 		 337 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.64 
 
 		 337 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.46 
 
 		 355 aa  498  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 		 347 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 338 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.95 
 
 		 338 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.46 
 
 		 337 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.26 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.07 
 
 		 336 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.37 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.37 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 		 335 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.17 
 
 		 339 aa  463  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.77 
 
 		 335 aa  451  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  61.31 
 
 		 342 aa  419  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  54.34 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 345 aa  339  4e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 335 aa  337  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 347 aa  329  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 347 aa  329  4e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 339 aa  328  7e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 328 aa  328  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 329 aa  325  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 329 aa  325  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 329 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 		 344 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.86 
 
 		 350 aa  322  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 344 aa  322  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 328 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 330 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 353 aa  318  9e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 353 aa  318  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 334 aa  318  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 341 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 344 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 353 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 329 aa  316  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 350 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 349 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 332 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 332 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 332 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 332 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 327 aa  311  6.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 332 aa  311  9e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 332 aa  311  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 345 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 341 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 337 aa  309  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 355 aa  308  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 355 aa  308  5.9999999999999995e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 365 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 346 aa  302  5.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 346 aa  302  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 357 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0797  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 353 aa  301  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 357 aa  301  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 334 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>