More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2568 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 344 aa  705    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  80.23 
 
 		 344 aa  585  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.88 
 
 		 350 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.3 
 
 		 349 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.43 
 
 		 350 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.43 
 
 		 348 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.24 
 
 		 347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.17 
 
 		 350 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.26 
 
 		 353 aa  554  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.26 
 
 		 353 aa  554  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.19 
 
 		 347 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.26 
 
 		 353 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.62 
 
 		 345 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.36 
 
 		 354 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.84 
 
 		 347 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.39 
 
 		 347 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.3 
 
 		 335 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.8 
 
 		 354 aa  505  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 		 355 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 		 355 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.23 
 
 		 354 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.14 
 
 		 355 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0026  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.72 
 
 		 354 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606354  normal  0.463115 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.75 
 
 		 332 aa  472  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.16 
 
 		 354 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.58 
 
 		 356 aa  458  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.5 
 
 		 344 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.87 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.87 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.05 
 
 		 342 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 341 aa  438  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.88 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 341 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.4 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 		 331 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1020  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 335 aa  326  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 336 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 		 337 aa  322  8e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 339 aa  312  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 337 aa  309  5e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 335 aa  308  6.999999999999999e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  46.65 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 332 aa  300  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 348 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 330 aa  296  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 337 aa  295  7e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 334 aa  295  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 334 aa  293  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 332 aa  292  7e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 347 aa  291  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 337 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 338 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 338 aa  285  9e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 346 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 334 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 334 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 334 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 334 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 334 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  43.06 
 
 		 360 aa  278  9e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>