More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0142 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  94.08 
 
 
355 aa  705    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
355 aa  734    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
355 aa  734    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.8 
 
 
355 aa  558  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.75 
 
 
354 aa  531  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0427  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.19 
 
 
354 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522536  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.86 
 
 
356 aa  533  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.52 
 
 
354 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0026  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.95 
 
 
354 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606354  normal  0.463115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.14 
 
 
353 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.86 
 
 
354 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.36 
 
 
345 aa  501  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.3 
 
 
353 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.45 
 
 
350 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.3 
 
 
353 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4409  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.54 
 
 
347 aa  494  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.95 
 
 
347 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 
344 aa  497  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.52 
 
 
347 aa  488  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.24 
 
 
350 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3413  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.54 
 
 
347 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.52 
 
 
348 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0583  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 
350 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109318  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 
349 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.9 
 
 
335 aa  474  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 
344 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 
332 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 
342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1808  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 
357 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0455  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 
357 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396107  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0466  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.89 
 
 
347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.21086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2836  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 
341 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0141096  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 
341 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 
345 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3953  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
339 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0672671  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 
344 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0082  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
331 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141856  normal  0.0206333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3827  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 
331 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0534777 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 
339 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1020  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 
333 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2013  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.75 
 
 
332 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
337 aa  319  5e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
335 aa  318  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
334 aa  318  9e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
355 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  47.16 
 
 
342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
332 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
332 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
327 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
332 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
332 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
336 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
337 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
334 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
336 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
332 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
336 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
334 aa  308  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
336 aa  305  7e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
330 aa  305  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
338 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
332 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
334 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
334 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
335 aa  301  8.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
332 aa  301  9e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
334 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  46 
 
 
337 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
334 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  44 
 
 
338 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
334 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
334 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
334 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
334 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
334 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
334 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
334 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  42.98 
 
 
334 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
334 aa  299  6e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
334 aa  298  8e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
334 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
346 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
334 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
337 aa  297  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
338 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
346 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
332 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
332 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
338 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
337 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  44.29 
 
 
360 aa  295  6e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
346 aa  295  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
328 aa  295  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
332 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>