More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18651 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 337 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  84.38 
 
 		 337 aa  591  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  84.08 
 
 		 337 aa  566  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.07 
 
 		 337 aa  537  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.77 
 
 		 337 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.92 
 
 		 337 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.86 
 
 		 338 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.56 
 
 		 338 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.86 
 
 		 338 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.76 
 
 		 347 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.97 
 
 		 355 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.06 
 
 		 336 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.27 
 
 		 337 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 		 336 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 		 336 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 		 339 aa  447  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.99 
 
 		 335 aa  440  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.67 
 
 		 335 aa  432  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  57.48 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  55.15 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 334 aa  330  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 336 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 348 aa  322  7e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 345 aa  322  8e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 339 aa  321  9.000000000000001e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 344 aa  318  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 328 aa  318  7e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 327 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 336 aa  317  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0216  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 347 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 332 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 332 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0360  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 344 aa  311  7.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 328 aa  309  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 332 aa  309  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00502  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 334 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 338 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 354 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 332 aa  302  5.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 334 aa  302  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 347 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0108214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 354 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 334 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 334 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 334 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 334 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  46.73 
 
 		 334 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 334 aa  301  9e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 334 aa  301  9e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 328 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 334 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 345 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4035  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 355 aa  299  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>