More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0168 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 333 aa  694    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.51 
 
 		 337 aa  521  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.58 
 
 		 335 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00502  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.99 
 
 		 335 aa  491  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.88 
 
 		 332 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.88 
 
 		 332 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.58 
 
 		 332 aa  487  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.58 
 
 		 332 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.28 
 
 		 332 aa  484  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.28 
 
 		 332 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.28 
 
 		 332 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.28 
 
 		 332 aa  482  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4257  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.69 
 
 		 335 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.58 
 
 		 332 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.58 
 
 		 332 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4193  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.58 
 
 		 332 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.58 
 
 		 332 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0246  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.58 
 
 		 336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0348  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.69 
 
 		 335 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3360  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.58 
 
 		 332 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.56 
 
 		 334 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 334 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 334 aa  448  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.47 
 
 		 334 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.94 
 
 		 346 aa  444  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.94 
 
 		 346 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 334 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 334 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 334 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 334 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 334 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 		 334 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.94 
 
 		 346 aa  444  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.66 
 
 		 334 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.35 
 
 		 333 aa  444  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 334 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 334 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 334 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 334 aa  440  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  63.06 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.72 
 
 		 338 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 		 365 aa  425  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2020  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.44 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000713321  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 334 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0574  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1560  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 341 aa  355  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1010  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 327 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 327 aa  352  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 344 aa  351  8e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 339 aa  350  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 344 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1229  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 344 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 346 aa  348  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25860  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 342 aa  345  6e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.986155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 332 aa  345  8e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0896  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 		 344 aa  344  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 332 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04760  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 		 360 aa  342  4e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.970086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7968  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 346 aa  342  8e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13369  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 336 aa  341  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1196  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000628566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 352 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0949  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1122  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 347 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.432931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1610  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 328 aa  335  9e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1087  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0894  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1297  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1075  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1232  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1336  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00399628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1259  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 329 aa  332  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1099  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 329 aa  332  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1188  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 329 aa  332  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0741  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0159074  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0797  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 353 aa  323  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07850  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 331 aa  323  4e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.939153  normal  0.972735 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 340 aa  322  7e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0984  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 357 aa  322  8e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1768  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 347 aa  318  7.999999999999999e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 328 aa  318  9e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 344 aa  317  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 348 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 336 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0128322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>