More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1038 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
405 aa  841    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.56 
 
 
405 aa  671    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.51 
 
 
404 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.54 
 
 
400 aa  622  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.62 
 
 
405 aa  621  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.04 
 
 
406 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.29 
 
 
400 aa  619  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.42 
 
 
400 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.42 
 
 
400 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.29 
 
 
404 aa  614  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.04 
 
 
400 aa  612  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.22 
 
 
400 aa  610  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.56 
 
 
404 aa  605  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.06 
 
 
404 aa  606  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.13 
 
 
400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.92 
 
 
400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.92 
 
 
400 aa  598  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.18 
 
 
400 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.19 
 
 
400 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.62 
 
 
400 aa  596  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.37 
 
 
400 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.44 
 
 
400 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.19 
 
 
400 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.44 
 
 
400 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.87 
 
 
400 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.11 
 
 
400 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.11 
 
 
400 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.86 
 
 
400 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.11 
 
 
400 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.11 
 
 
400 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.11 
 
 
400 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.11 
 
 
400 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.37 
 
 
400 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.11 
 
 
400 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.49 
 
 
391 aa  584  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 
404 aa  557  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.5 
 
 
402 aa  554  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.69 
 
 
403 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.69 
 
 
403 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
330 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
329 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  45 
 
 
331 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
331 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
330 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
329 aa  343  4e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
328 aa  339  5e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
328 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
325 aa  335  9e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
330 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
329 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
329 aa  307  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
326 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
330 aa  296  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
354 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
337 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
327 aa  280  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
392 aa  276  4e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  38.44 
 
 
331 aa  274  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.7 
 
 
327 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
323 aa  271  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
323 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
340 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.53 
 
 
327 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
340 aa  263  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.37 
 
 
327 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
391 aa  258  1e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
340 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.4 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 
332 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.58 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.79 
 
 
329 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 
329 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
339 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
356 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
356 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.37 
 
 
327 aa  230  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.24 
 
 
326 aa  229  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  35.4 
 
 
340 aa  226  8e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  35.64 
 
 
341 aa  225  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
346 aa  223  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  34.5 
 
 
341 aa  222  9e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.14 
 
 
329 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  35.01 
 
 
342 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  35.01 
 
 
342 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 
352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 
328 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 
328 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6431  tryptophanyl-tRNA synthetase II  34.26 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5680  tryptophanyl-tRNA synthetase II  34.26 
 
 
337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  normal  0.353927 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
373 aa  210  5e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
346 aa  209  6e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 
327 aa  202  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>