More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1224 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
373 aa  780    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
329 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
331 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
328 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  44 
 
 
331 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
330 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  45 
 
 
325 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
327 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
328 aa  319  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
327 aa  317  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
359 aa  311  9e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
330 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
327 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
332 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
327 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 
330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
329 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
329 aa  297  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
329 aa  295  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
326 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
329 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
329 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
329 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
327 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
324 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
323 aa  275  8e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
323 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
404 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
404 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  39.07 
 
 
331 aa  262  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
348 aa  262  8e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
340 aa  261  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
354 aa  260  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
340 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
400 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
331 aa  257  3e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
400 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
342 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
400 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
405 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
406 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
400 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
340 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
400 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
400 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
328 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
328 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
340 aa  248  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
400 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
400 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
327 aa  247  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
400 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
400 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
400 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
325 aa  245  6.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
400 aa  245  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
400 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
400 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
400 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
403 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
403 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
391 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
402 aa  238  9e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
335 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 
327 aa  230  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.07 
 
 
340 aa  228  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
351 aa  226  7e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.01 
 
 
346 aa  223  4e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.5 
 
 
340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  36.19 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  35.62 
 
 
341 aa  220  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  36.17 
 
 
341 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 
330 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  34.51 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  36.22 
 
 
339 aa  212  9e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
346 aa  211  2e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  34.42 
 
 
342 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>