More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6975 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6975  tryptophanyl-tRNA synthetase II  100 
 
 
337 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6431  tryptophanyl-tRNA synthetase II  97.03 
 
 
337 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  96.44 
 
 
337 aa  661    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5680  tryptophanyl-tRNA synthetase II  96.74 
 
 
337 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  normal  0.353927 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6416  tryptophanyl-tRNA synthetase II  96.44 
 
 
337 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7076  tryptophanyl-tRNA synthetase II  96.44 
 
 
337 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  86.1 
 
 
342 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  85.07 
 
 
342 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  67.86 
 
 
339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  65.77 
 
 
346 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  65.77 
 
 
346 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  65.77 
 
 
346 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  65.77 
 
 
346 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  65.77 
 
 
346 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  64.35 
 
 
342 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  65.77 
 
 
346 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  65.77 
 
 
346 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  61.7 
 
 
335 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01774  tryptophanyl-tRNA synthetase II  61.03 
 
 
340 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  62.54 
 
 
366 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  62.54 
 
 
342 aa  418  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003890  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 
340 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2364  tryptophanyl-tRNA synthetase II  63.72 
 
 
333 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0512  tryptophanyl-tRNA synthetase II  64.86 
 
 
346 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0485  tryptophanyl-tRNA synthetase II  58.43 
 
 
334 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4862  tryptophanyl-tRNA synthetase II  59.63 
 
 
337 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.217158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4912  tryptophanyl-tRNA synthetase II  59.94 
 
 
337 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4909  tryptophanyl-tRNA synthetase II  59.63 
 
 
337 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.229127  normal  0.0358583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4838  tryptophanyl-tRNA synthetase II  59.94 
 
 
337 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4762  tryptophanyl-tRNA synthetase II  59.63 
 
 
337 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.586002 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1026  tryptophanyl-tRNA synthetase II  56.08 
 
 
345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.84 
 
 
384 aa  395  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  58.41 
 
 
340 aa  392  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  58.13 
 
 
340 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  57.66 
 
 
346 aa  385  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  56.8 
 
 
341 aa  378  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  56.02 
 
 
341 aa  377  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  55.62 
 
 
341 aa  374  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  55.36 
 
 
339 aa  373  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  54.26 
 
 
357 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 
360 aa  363  3e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 
337 aa  305  8.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  45.99 
 
 
331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
335 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
335 aa  265  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
331 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
356 aa  259  6e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
356 aa  259  6e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
352 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
325 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
329 aa  225  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
348 aa  223  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
329 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
329 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
342 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
346 aa  218  1e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
354 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
340 aa  218  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
328 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
328 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
340 aa  215  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
330 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
324 aa  212  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
326 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
331 aa  212  7e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
329 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
329 aa  209  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
329 aa  209  8e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1317  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
348 aa  208  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0172213  normal  0.0239999 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  39.35 
 
 
363 aa  207  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
355 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
349 aa  206  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
328 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
326 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
327 aa  205  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3900  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
343 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.93635  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4636  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
354 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.0639753 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
328 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
329 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
330 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 
373 aa  203  4e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
327 aa  202  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06710  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
331 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1867  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.705084  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1340  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
410 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1393  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12310  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.846679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0653  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
346 aa  195  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>