More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1340 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1340  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
410 aa  799    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12310  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 
358 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.846679  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  57.39 
 
 
363 aa  412  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1393  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 
349 aa  402  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0653  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 
349 aa  400  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1317  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 
348 aa  401  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0172213  normal  0.0239999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4636  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 
354 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.0639753 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06710  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.62 
 
 
362 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1867  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.34 
 
 
370 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.705084  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1781  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 
351 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000215592  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 
355 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3900  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.18 
 
 
343 aa  360  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.93635  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.98 
 
 
342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
360 aa  234  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
331 aa  229  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.32 
 
 
341 aa  228  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.37 
 
 
340 aa  227  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  40.48 
 
 
331 aa  227  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.27 
 
 
340 aa  226  8e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.04 
 
 
335 aa  223  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.42 
 
 
341 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.96 
 
 
339 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.69 
 
 
342 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.99 
 
 
342 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.54 
 
 
346 aa  218  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.03 
 
 
366 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.07 
 
 
342 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01774  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.43 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
330 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.33 
 
 
346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.33 
 
 
346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.33 
 
 
346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.33 
 
 
346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.33 
 
 
346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.33 
 
 
346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.33 
 
 
346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.64 
 
 
341 aa  211  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
323 aa  209  6e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003890  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
340 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
327 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
328 aa  206  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.29 
 
 
357 aa  205  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
327 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.18 
 
 
337 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6416  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.18 
 
 
337 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7076  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.18 
 
 
337 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478137 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
323 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
342 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
340 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4838  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.34 
 
 
337 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5680  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.88 
 
 
337 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  normal  0.353927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
326 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4762  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.34 
 
 
337 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.586002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4912  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.34 
 
 
337 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
323 aa  202  7e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4909  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.34 
 
 
337 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.229127  normal  0.0358583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
335 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1026  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.27 
 
 
345 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6431  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.58 
 
 
337 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.94 
 
 
339 aa  202  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4862  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.34 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.217158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
327 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6975  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.27 
 
 
337 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
329 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
340 aa  199  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
329 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
335 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
325 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
354 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
328 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
329 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0512  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.72 
 
 
346 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
340 aa  192  9e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3557  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
352 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
329 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0485  tryptophanyl-tRNA synthetase II  36.78 
 
 
334 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
346 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
327 aa  190  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
328 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
328 aa  189  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
327 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
348 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
339 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
340 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2364  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.39 
 
 
333 aa  186  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
329 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
321 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
331 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
338 aa  181  2e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
329 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
337 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
333 aa  180  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>