More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1406 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  100 
 
 
335 aa  689    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003890  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 
340 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01774  tryptophanyl-tRNA synthetase II  66.46 
 
 
340 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1026  tryptophanyl-tRNA synthetase II  64.63 
 
 
345 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4862  tryptophanyl-tRNA synthetase II  66.15 
 
 
337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.217158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4838  tryptophanyl-tRNA synthetase II  65.85 
 
 
337 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4909  tryptophanyl-tRNA synthetase II  65.85 
 
 
337 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.229127  normal  0.0358583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4912  tryptophanyl-tRNA synthetase II  65.85 
 
 
337 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4762  tryptophanyl-tRNA synthetase II  65.54 
 
 
337 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.586002 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0485  tryptophanyl-tRNA synthetase II  62.92 
 
 
334 aa  437  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  63.41 
 
 
342 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  63.72 
 
 
342 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6431  tryptophanyl-tRNA synthetase II  61.7 
 
 
337 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6975  tryptophanyl-tRNA synthetase II  61.7 
 
 
337 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7076  tryptophanyl-tRNA synthetase II  61.89 
 
 
337 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  62.2 
 
 
337 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5680  tryptophanyl-tRNA synthetase II  61.7 
 
 
337 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  normal  0.353927 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6416  tryptophanyl-tRNA synthetase II  62.2 
 
 
337 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  61.59 
 
 
366 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  60.96 
 
 
339 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  60.67 
 
 
342 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  59.44 
 
 
346 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  59.44 
 
 
346 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  59.44 
 
 
346 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  59.44 
 
 
346 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0512  tryptophanyl-tRNA synthetase II  59.75 
 
 
346 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  59.44 
 
 
346 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  58.36 
 
 
342 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  59.44 
 
 
346 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  59.44 
 
 
346 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  57.01 
 
 
340 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2364  tryptophanyl-tRNA synthetase II  57.54 
 
 
333 aa  388  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  57.61 
 
 
340 aa  388  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  55.72 
 
 
346 aa  387  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  56.72 
 
 
341 aa  382  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  55.06 
 
 
341 aa  378  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  54.82 
 
 
339 aa  361  7.0000000000000005e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 
384 aa  357  9.999999999999999e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
360 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  52.57 
 
 
341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  48.59 
 
 
357 aa  344  1e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
333 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
337 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  44.51 
 
 
331 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
335 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
335 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
352 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
331 aa  256  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
356 aa  252  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
356 aa  252  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
329 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1340  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3900  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.93635  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  41.07 
 
 
363 aa  220  3e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1317  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
348 aa  219  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0172213  normal  0.0239999 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
325 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
330 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
346 aa  216  5e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0653  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
349 aa  214  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1393  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12310  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.846679  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
329 aa  212  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
342 aa  212  7e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
349 aa  209  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
328 aa  209  5e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
328 aa  209  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
330 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
327 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
340 aa  209  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
327 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
329 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
348 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
329 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
327 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
327 aa  205  8e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 
359 aa  205  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
329 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
330 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
328 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 
373 aa  202  7e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
326 aa  202  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
340 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
326 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
354 aa  199  6e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1867  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
370 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.705084  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
331 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06710  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4636  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.0639753 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
340 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
331 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1781  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
351 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000215592  normal  0.125783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>