More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2364 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2364  tryptophanyl-tRNA synthetase II  100 
 
 
333 aa  672    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  70.82 
 
 
366 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  69.3 
 
 
342 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  69.51 
 
 
346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  69.51 
 
 
346 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  69.51 
 
 
346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  69.51 
 
 
346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  69.51 
 
 
346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  69.51 
 
 
346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  69.51 
 
 
346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0512  tryptophanyl-tRNA synthetase II  69.21 
 
 
346 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  60.78 
 
 
339 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  63.83 
 
 
342 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  63.91 
 
 
342 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  63.83 
 
 
337 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6431  tryptophanyl-tRNA synthetase II  63.83 
 
 
337 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5680  tryptophanyl-tRNA synthetase II  63.83 
 
 
337 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  normal  0.353927 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6416  tryptophanyl-tRNA synthetase II  63.83 
 
 
337 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7076  tryptophanyl-tRNA synthetase II  63.53 
 
 
337 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478137 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6975  tryptophanyl-tRNA synthetase II  63.72 
 
 
337 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01774  tryptophanyl-tRNA synthetase II  57.7 
 
 
340 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003890  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 
340 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4838  tryptophanyl-tRNA synthetase II  57.14 
 
 
337 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4912  tryptophanyl-tRNA synthetase II  56.93 
 
 
337 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4862  tryptophanyl-tRNA synthetase II  56.63 
 
 
337 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.217158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4909  tryptophanyl-tRNA synthetase II  56.84 
 
 
337 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.229127  normal  0.0358583 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1026  tryptophanyl-tRNA synthetase II  55.38 
 
 
345 aa  394  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4762  tryptophanyl-tRNA synthetase II  56.84 
 
 
337 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.586002 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  57.54 
 
 
335 aa  388  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0485  tryptophanyl-tRNA synthetase II  55.72 
 
 
334 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  57.58 
 
 
342 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  55.12 
 
 
340 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  54.19 
 
 
346 aa  376  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  53.71 
 
 
341 aa  371  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  53.12 
 
 
341 aa  366  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  53.12 
 
 
340 aa  363  3e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  50.9 
 
 
341 aa  362  6e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  52.1 
 
 
339 aa  360  2e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  54.2 
 
 
357 aa  359  4e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 
384 aa  359  4e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
360 aa  334  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
337 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
333 aa  273  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
356 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
356 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
335 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
351 aa  249  3e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
335 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
352 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  41.54 
 
 
331 aa  246  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
325 aa  232  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
329 aa  231  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
330 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
329 aa  217  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
328 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
328 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
329 aa  208  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
340 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
340 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
330 aa  206  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
331 aa  206  5e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
326 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
329 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
330 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
329 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
359 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
329 aa  202  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
349 aa  200  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
339 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12310  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.846679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
327 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1317  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
348 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0172213  normal  0.0239999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
340 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
328 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3900  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
343 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.93635  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
331 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
354 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 
330 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 
342 aa  189  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 
328 aa  189  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
327 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 
346 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 
331 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
329 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  36.86 
 
 
363 aa  186  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1340  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
410 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
327 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
340 aa  185  8e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  37 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1393  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
363 aa  183  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06710  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
362 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0653  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
349 aa  182  5.0000000000000004e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>