More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1745 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 317 aa  650    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  73.73 
 
 		 317 aa  486  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  61.46 
 
 		 325 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 		 315 aa  403  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  59.81 
 
 		 316 aa  394  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 313 aa  393  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  60.38 
 
 		 313 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  58.58 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 311 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 309 aa  328  6e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 326 aa  328  7e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 328 aa  328  9e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 319 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 345 aa  252  7e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.134305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 361 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 338 aa  232  6e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 352 aa  223  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 404 aa  216  5e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 374 aa  192  6e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 372 aa  189  4e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  33.82 
 
 		 824 aa  189  4e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  36.73 
 
 		 349 aa  189  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 336 aa  178  9e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  31.06 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  27.73 
 
 		 791 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 400 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 407 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 405 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 		 403 aa  102  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 402 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 414 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3406  tyrosyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 413 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 413 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 413 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  31.05 
 
 		 438 aa  99.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 413 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 413 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0697  tyrosyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 		 400 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000250226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 406 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 401 aa  99.4  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 		 398 aa  99  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1240  tyrosyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 413 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 413 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 413 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 413 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 413 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 403 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 407 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 435 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2138  tyrosyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000157826  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 403 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 400 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 413 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  31.2 
 
 		 432 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 		 413 aa  97.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 399 aa  96.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 454 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 401 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 413 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 403 aa  96.3  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 405 aa  95.9  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 		 399 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4565  tyrosyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 		 403 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000112799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0140  tyrosyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.485656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 403 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024569  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0352  tyrosyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 398 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 396 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 		 404 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>